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Linux系统中的命令实在是太多了,简单包括两类命令,一类是内部命令,指的是Shell自身提供的功能,一类是外部命令,指的是第三方的控制台应用程序。
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一般来说,没必要完全学习所有的命令,大体上有个印象,用到的时候去查一下帮助文档,久而久之,自然熟练。
下面是网友整理的20个最常用的Linux命令:
1. ls命令
ls命令是列出目录内容(List Directory Contents)的意思。运行它就是列出文件夹里的内容,可能是文件也可能是文件夹。
2. lsblk命令
"lsblk"就是列出块设备。除了RAM外,以标准的树状输出格式,整齐地显示块设备。
3. md5sum命令
“md5sum”就是计算和检验MD5信息签名。md5 checksum(通常叫做哈希)使用匹配或者验证文件的文件的完整性,因为文件可能因为传输错误,磁盘错误或者无恶意的干扰等原因而发生改变。
4. dd命令
“dd”命令代表了转换和复制文件。可以用来转换和复制文件,大多数时间是用来复制iso文件(或任何其它文件)到一个usb设备(或任何其它地方)中去,所以可以用来制作USB启动器。
6. history命令
“history”命令就是历史记录。它显示了在终端中所执行过的所有命令的历史。
7. sudo命令
“sudo”(super user do)命令允许授权用户执行超级用户或者其它用户的命令。通过在sudoers列表的安全策略来指定。
8. mkdir命令
“mkdir”(Make directory)命令在命名路径下创建新的目录。然而如果目录已经存在了,那么它就会返回一个错误信息"不能创建文件夹,文件夹已经存在了"("cannot create folder, folder already exists")
9. touch 命令
“touch”命令代表了将文件的访问和修改时间更新为当前时间。touch命令只会在文件不存在的时候才会创建它。如果文件已经存在了,它会更新时间戳,但是并不会改变文件的内容。
10. chmod 命令
“chmod”命令就是改变文件的模式位。chmod会根据要求的模式来改变每个所给的文件,文件夹,脚本等等的文件模式(权限)。
11. chown命令
“chown”命令就是改变文件拥有者和所在用户组。每个文件都属于一个用户组和一个用户。在你的目录下,使用"ls -l",你就会看到像这样的东西。
12. apt命令
Debian系列以“apt”命令为基础,“apt”代表了Advanced Package Tool。APT是一个为Debian系列系统(Ubuntu,Kubuntu等等)开发的高级包管理器,在Gnu/Linux系统上,它会为包自动地,智能地搜索,安装,升级以及解决依赖。
13. tar命令
“tar”命令是磁带归档(Tape Archive),对创建一些文件的的归档和它们的解压很有用。
14. cal 命令
“cal”(Calender),它用来显示当前月份或者未来或者过去任何年份中的月份。
16. cat命令
“cat”代表了连结(Concatenation),连接两个或者更多文本文件或者以标准输出形式打印文件的内容。
17. cp 命令
“copy”就是复制。它会从一个地方复制一个文件到另外一个地方。
18. mv 命令
“mv”命令将一个地方的文件移动到另外一个地方去。
19. pwd 命令
“pwd”(print working directory),在终端中显示当前工作目录的全路径。
20. cd 命令
最后,经常使用的“cd”命令代表了改变目录。它在终端中改变工作目录来执行,复制,移动,读,写等等操作。
uname -a
2. cat /proc/version
3. cat /etc/issue
4. lsb_release -a
详解 lsb_release -a
1. 登录到服务器执行 lsb_release -a ,即可列出所有版本信息,例如:
1. [root@3.5.5Biz-46 ~]# lsb_release -a
2. LSB Version: 1.3
3. Distributor ID: RedHatEnterpriseAS
4. Description: Red Hat Enterprise Linux AS release 4 (Nahant Update 1)
5. Release: 4
6. Codename: NahantUpdate1
7. [root@3.5.5Biz-46 ~]#
这个命令适用于所有的linux,包括Redhat、SuSE、Debian等发行版
在每个用户的家目录里,看文本命令很多,如: cat \ more \ less \ vi 等等这些命令都可以看某个用户的 .bash_history 文件。
例:# more ~user/.bash_history 看 user 用户的历史命令,但是你要访问的权限才行。
忘说了,看的是上次的历史命令 :em02:
查看系统之前的命令是。hisotry。
history主要是将之前所执行的命令存放起来,但是如果要找到当前系统执行的第一条命令,估计在命令上实现不了。1,可以选择之前命令执行了多少,然后看看history的标号可以找出来。2,也可以创建一个脚本,将之前的命令保存起来,然后在登出初始化的时候将本次系统的命令记录clear一下。每次登录的系统第一条命令就是history下标号为1的命令了。
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令:
通过多敲键盘,形成手感 肌肉记忆 ,熟练掌握这些命令,在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍(主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记)
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来:
参数的用法介绍:
注意事项:
用 cat 命令可以 查看文本 ,也可以 编辑文本 ,编辑文本要加 符号,退出时,另起一行,按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件,tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行,默认 10 行 (在R语言里head和tail默认是前6行)。
less命令用得最多 ,more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 :
需要注意 退出 :只要使用less命令, 按q键
less命令重要的补充用法2 :
参数用法:
less命令 不加参数 查看文件:
less命令加 -N参数 查看文件:显示行号
less命令加 -S参数 查看文件:单行显示,非常规整
对比:less和cat命令显示文本行号的用法:less -N,cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看,按空格翻页,按回车换行 ,more命令一般很少用,熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去,但是别的命令不一定会把换行符算进去,。
常见参数:
切记:用less命令,按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前:
排列后:
解释:1和0比,1大;7和0比,7大…在sort字典排序里,100816比1737小,所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时,因为制表符对齐的原因,出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样,所以 加上-n参数 , 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重,只有两行出现重复,而且是相邻的两行,如果不相邻,即使出现两行一模一样,不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之,uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1:
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯,原始数据不要轻易修改,修改的东西另外保存,文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ,然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上,将空格替换成制表符
补充小知识 :
清屏 :control L
查看历史(输入过的)命令 :history