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在很多人学习Linux命令行,会经常遇到command not found 错误,出现上述错误主要有以下几种情况:
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命令书写错误,如有些人将Windows命令与Linux命令搞错,如查看ip相关信息,Linux命令行应该为ifconfig
环境变量没有配置好,这里一般有两种解决方法,第一,可以切换到root用户执行命令,第二种,就是配置用户的环境变量,其指令如下:
export PATH=/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin
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Linux命令找不到?(找不到命令)
这个问题其实很简单,如果你在终端输入一个命令,而系统提示你说命令没有找到(Command not found)的话,要么是因为你没有装相应的软件包,要么就是因为路径设置的问题。如果是因为软件包的问题,那没有别的好说的,安装相应的软件包就好了。而另外一种情况,则需要对用户的路径进行设置。这里针对普通用户和超级用户分开介绍,以 RedHat 些列为例。
一、普通用乎如果一些程序没有安装在系统默认的路径(ie /bin/, /usr/bin, /usr/local/bin/ )里面,这个时候普通用户想要调用这些命令,必须设定路径。方法很简单:以普通用户登录,然后在终端输入:
vi ~/.bash_profile
会出现如下的内容:# .bash_profile
export PATH此时,只要在export PATH前面加入自己的路径即可,例如我的修改后如下:[ @localhost bin]$ cat ~/.bash_profile# .bash_profile# Get the aliases and functionsif [ -f ~/.bashrc ]; then . ~/.bashrcfi# User specific environment and startup programsPATH=$PATH:/usr/local/programs/crosstool/gcc-4.0.2-glibc-2.3.6/arm-linux-gnu/bin/export PATH
二、超级用户这里主要是一些用在系统管理上的命令,例如ifconfig, route等等, 他们位于/sbin, 或/usr/sbin/下。其实这些命令本身就没有任何问题,软件包早已安装完毕,路径设置也没有丝毫问题。而出现Command not found的原因在于:在终端使用su变成超级用户的时候没有将root的路径(环境)一起切换过来,从而导致身份虽然已经是root,但是工作的环境和路径依旧是普通用户的。这种问题的解决方法有两个,其一是按照(一)里面提到的,对普通用户的工作路径进行修改,但是这样比较麻烦。其二则简单的多,只要在使用su的时候在其后家上一个空格和”-“ ,即将su改为 su - 。这样就可以在成为root的同时将root的工作路径也一起切换过来了。如果你已经使用su变成了root,那也没有关系,只要在输入一下su - 就好了。
原文地址:
本文讲述了linux命令行乱码的解决方式,以下为具体操作步骤:
想解决linux命令行乱码,只要打开/etc/sysconfig/i18n这个文件,在里面加上如下代码即可:
#LANG="zh_CN.UTF-8"
#SYSF
LANG=zh_CN.GB18030
LANGUAGE=en_US.UTF-8
LC_CTYPE=zh_CN.GB18030
LC_TIME=en_US.UTF-8
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令:
通过多敲键盘,形成手感 肌肉记忆 ,熟练掌握这些命令,在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍(主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记)
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来:
参数的用法介绍:
注意事项:
用 cat 命令可以 查看文本 ,也可以 编辑文本 ,编辑文本要加 符号,退出时,另起一行,按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件,tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行,默认 10 行 (在R语言里head和tail默认是前6行)。
less命令用得最多 ,more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 :
需要注意 退出 :只要使用less命令, 按q键
less命令重要的补充用法2 :
参数用法:
less命令 不加参数 查看文件:
less命令加 -N参数 查看文件:显示行号
less命令加 -S参数 查看文件:单行显示,非常规整
对比:less和cat命令显示文本行号的用法:less -N,cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看,按空格翻页,按回车换行 ,more命令一般很少用,熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去,但是别的命令不一定会把换行符算进去,。
常见参数:
切记:用less命令,按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前:
排列后:
解释:1和0比,1大;7和0比,7大…在sort字典排序里,100816比1737小,所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时,因为制表符对齐的原因,出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样,所以 加上-n参数 , 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重,只有两行出现重复,而且是相邻的两行,如果不相邻,即使出现两行一模一样,不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之,uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1:
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯,原始数据不要轻易修改,修改的东西另外保存,文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ,然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上,将空格替换成制表符
补充小知识 :
清屏 :control L
查看历史(输入过的)命令 :history
如果不是自己写的程序,建议先阅读一下文档
是不是文件的权限,目录,环境变量,使用方法等有问题。
如果是自己写的
那么出现段错误 有可能是越界等错误
建议GDB调试,或检查源码