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df -h查看空间使用情况
警惕超大 nohup.out
任务提交
任务提交前
qhost--查看集群负载状态
qsub / qsub-sge.pl--提交任务
qstat--查看任务状态
qdel / qmod--任务控制
任务查看
qhost -j---列出所有用户在每个节点上的任务
qhost -q---列出每个节点上每个队列的任务数
qhost -u username---列出某个用户在每个节点上的任务
提交命令
qsub -cwd -q queue.q test.sh
qsub-sge.pl --maxproc 50 --resource vf=5G --queue queue.q test.sh
任务查看2
qstat -u username---查看某个用户的任务
qstat -u *,---查看所有用户的任务
qstat –j jobs_ID---查看某个任务的详细信息
查看.e和.o文件
.e:错误信息
.o:标准输出
任务控制
qdel jobID---删除某个任务
qdel -u username---删除某个用户的所有任务
qmod -s jobID--挂起某个任务
qmod -us jobID---继续运行某个挂起的任务
按任务占用内存大小选择相应的队列
查看队列 qstat -g c
QUEUE
PE.q--并行
cloud.q--云平台
general.q--96G节点
middle.q--96G节点
great.q--大内存节点
plus.q--大内存节点
single.q--Trinity组装
single._p.q---Trinity组装(占用内存较大)
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编辑于 2017-04-21
姓名:张昊楠 学号:21021210691
存储NAS 文件操作
df -h查看空间使用情况
警惕超大 nohup.out
ls 当前路径下的文件列表
pwd 查看当前路径
cd 进入某个文件夹
任务提交
任务提交前
qhost--查看集群负载状态
qsub / qsub-sge.pl--提交任务
qstat--查看任务状态
qdel / qmod--任务控制
任务查看
qhost -j---列出所有用户在每个节点上的任务
qhost -q---列出每个节点上每个队列的任务数
qhost -u username---列出某个用户在每个节点上的任务
提交命令
qsub -cwd -q queue.q test.sh
qsub-sge.pl --maxproc 50 --resource vf=5G --queue queue.q test.sh
任务查看2
qstat -u username---查看某个用户的任务
qstat -u *,---查看所有用户的任务
qstat –j jobs_ID---查看某个任务的详细信息
查看.e和.o文件
.e:错误信息
.o:标准输出
任务控制
qdel jobID---删除某个任务
qdel -u username---删除某个用户的所有任务
qmod -s jobID--挂起某个任务
qmod -us jobID---继续运行某个挂起的任务
按任务占用内存大小选择相应的队列
查看队列 qstat -g c
QUEUE
PE.q--并行
cloud.q--云平台
general.q--96G节点
middle.q--96G节点
great.q--大内存节点
plus.q--大内存节点
single.q--Trinity组装
single._p.q---Trinity组装(占用内存较大)
Linux在启动一个进程时,系统会在/proc下创建一个以PID命名的文件夹,在该文件夹下会有我们的进程的信息.
这些信息,有的是软链接,有的是文本,有的是目录.
查看这些信息需要对应的权限.
其中部分常用信息如下.
cwd 符号链接, 是进程运行目录. sudo ls -al /proc/PID/cwd
exe 符号连接, 是执行程序的绝对路径. sudo ls -al /proc/PID/exe
cmdline 文本, 是程序运行时输入的命令行命令. sudo cat /proc/PID/cmdline
environ 文本, 记录了进程运行时的环境变量. sudo cat /proc/PID/environ
fd 目录, 里面是进程打开或使用的文件的符号连接. sudo ls -al /proc/PID/fd